Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE12Q6L8Q7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE12Q6L8Q7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms