Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E1Q6IPT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM71E1Q6IPT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E1Q6IPT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms