Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFRP4Q6FHJ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFRP4Q6FHJ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFRP4Q6FHJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms