Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNS3Q68CZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TNS3Q68CZ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TNS3Q68CZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms