Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRAGBQ5VZM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRAGBQ5VZM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRAGBQ5VZM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms