Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EFCAB2Q5VUJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EFCAB2Q5VUJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EFCAB2Q5VUJ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms