Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATAD3CQ5T2N8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3CQ5T2N8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.4 ms