Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML2Q5T2D2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREML2Q5T2D2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML2Q5T2D2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms