Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSL3PQ5NE16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTSL3PQ5NE16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSL3PQ5NE16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms