Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SDK2Q58EX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDK2Q58EX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDK2Q58EX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms