Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TDRD12Q587J7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRD12Q587J7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRD12Q587J7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms