Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALFQ53S48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms