Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP29Q52LW3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGAP29Q52LW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGAP29Q52LW3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms