Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDRF1Q3B7T1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDRF1Q3B7T1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDRF1Q3B7T1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms