Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC96Q2M329 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC96Q2M329 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC96Q2M329 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms