Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTF1Q16619 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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