Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWIST1Q15672 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TWIST1Q15672 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TWIST1Q15672 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWIST1Q15672 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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