Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT31Q15323 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT31Q15323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms