Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HNF4GQ14541 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HNF4GQ14541 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HNF4GQ14541 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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