Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN5AQ14524 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN5AQ14524 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN5AQ14524 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
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