Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CDK13Q14004 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CDK13Q14004 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK13Q14004 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK13Q14004 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
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