Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF9Q13886 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF9Q13886 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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