Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CUL4AQ13619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4AQ13619 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4AQ13619 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4AQ13619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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