Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHAF1AQ13111 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAF1AQ13111 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHAF1AQ13111 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
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