Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPP2Q13103 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPP2Q13103 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPP2Q13103 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPP2Q13103 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPP2Q13103 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.9 ms