Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPRL3Q12980 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPRL3Q12980 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPRL3Q12980 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms