Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTP4A2Q12974 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTP4A2Q12974 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTP4A2Q12974 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTP4A2Q12974 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms