Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GRIN2AQ12879 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
GRIN2AQ12879 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
GRIN2AQ12879 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
GRIN2AQ12879 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
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