Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB40BQ12829 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
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RAB40BQ12829 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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