Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
HMGXB3Q12766 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC43.42■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
HMGXB3Q12766 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
HMGXB3Q12766 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC43.31■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
HMGXB3Q12766 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
HMGXB3Q12766 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
HMGXB3Q12766 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms