Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNA1Q09470 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNA1Q09470 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms