Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD51Q06609 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51Q06609 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51Q06609 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms