Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMX1Q04741 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms