Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARID5AQ03989 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID5AQ03989 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID5AQ03989 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms