Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APBA1Q02410 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APBA1Q02410 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APBA1Q02410 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms