Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDR2Q01850 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDR2Q01850 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDR2Q01850 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms