Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB1Q01826 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SATB1Q01826 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms