Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPS9P82933 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPS9P82933 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPS9P82933 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms