Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIP4K2BP78356 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIP4K2BP78356 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.82■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PIP4K2BP78356 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms