Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBE2HP62256 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE2HP62256 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2HP62256 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms