Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4BP61018 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4BP61018 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms