Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB15P59190 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB15P59190 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB15P59190 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB15P59190 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB15P59190 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB15P59190 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB15P59190 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB15P59190 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB15P59190 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB15P59190 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB15P59190 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB15P59190 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB15P59190 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB15P59190 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB15P59190 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB15P59190 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB15P59190 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB15P59190 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB15P59190 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB15P59190 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB15P59190 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB15P59190 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB15P59190 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB15P59190 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB15P59190 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms