Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EEFSECP57772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEFSECP57772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEFSECP57772 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms