Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASP7P55210 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASP7P55210 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASP7P55210 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASP7P55210 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASP7P55210 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASP7P55210 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CASP7P55210 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP7P55210 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP7P55210 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP7P55210 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP7P55210 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP7P55210 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CASP7P55210 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP7P55210 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP7P55210 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP7P55210 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP7P55210 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP7P55210 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP7P55210 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP7P55210 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP7P55210 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASP7P55210 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASP7P55210 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP7P55210 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASP7P55210 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASP7P55210 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASP7P55210 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASP7P55210 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP7P55210 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP7P55210 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP7P55210 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP7P55210 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP7P55210 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP7P55210 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP7P55210 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP7P55210 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CASP7P55210 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CASP7P55210 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms