Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYS2P54840 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GYS2P54840 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GYS2P54840 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GYS2P54840 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GYS2P54840 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GYS2P54840 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GYS2P54840 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GYS2P54840 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GYS2P54840 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GYS2P54840 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GYS2P54840 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GYS2P54840 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GYS2P54840 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GYS2P54840 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GYS2P54840 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GYS2P54840 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GYS2P54840 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GYS2P54840 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GYS2P54840 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYS2P54840 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYS2P54840 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYS2P54840 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYS2P54840 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GYS2P54840 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GYS2P54840 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GYS2P54840 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GYS2P54840 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GYS2P54840 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GYS2P54840 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYS2P54840 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYS2P54840 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms