Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATN1P54259 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATN1P54259 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATN1P54259 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATN1P54259 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATN1P54259 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATN1P54259 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATN1P54259 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATN1P54259 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATN1P54259 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATN1P54259 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATN1P54259 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATN1P54259 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATN1P54259 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATN1P54259 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATN1P54259 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATN1P54259 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATN1P54259 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATN1P54259 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATN1P54259 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATN1P54259 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATN1P54259 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATN1P54259 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATN1P54259 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATN1P54259 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATN1P54259 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATN1P54259 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATN1P54259 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATN1P54259 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATN1P54259 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATN1P54259 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATN1P54259 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATN1P54259 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATN1P54259 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATN1P54259 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATN1P54259 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATN1P54259 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATN1P54259 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATN1P54259 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATN1P54259 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATN1P54259 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATN1P54259 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATN1P54259 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATN1P54259 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATN1P54259 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATN1P54259 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATN1P54259 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATN1P54259 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATN1P54259 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATN1P54259 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATN1P54259 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATN1P54259 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms