Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC3P51654 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC3P51654 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC3P51654 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC3P51654 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC3P51654 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC3P51654 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC3P51654 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC3P51654 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC3P51654 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC3P51654 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC3P51654 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC3P51654 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC3P51654 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC3P51654 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC3P51654 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC3P51654 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC3P51654 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC3P51654 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC3P51654 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC3P51654 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC3P51654 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC3P51654 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC3P51654 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC3P51654 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GPC3P51654 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC3P51654 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC3P51654 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC3P51654 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC3P51654 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC3P51654 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC3P51654 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC3P51654 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC3P51654 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC3P51654 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC3P51654 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC3P51654 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC3P51654 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC3P51654 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC3P51654 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC3P51654 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC3P51654 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC3P51654 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC3P51654 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC3P51654 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC3P51654 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms