Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3P48764 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms