Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCLCP48506 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCLCP48506 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCLCP48506 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLCP48506 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLCP48506 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLCP48506 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLCP48506 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLCP48506 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLCP48506 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLCP48506 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLCP48506 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLCP48506 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLCP48506 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLCP48506 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCLCP48506 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCLCP48506 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCLCP48506 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLCP48506 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLCP48506 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLCP48506 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLCP48506 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLCP48506 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCLCP48506 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCLCP48506 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLCP48506 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLCP48506 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLCP48506 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLCP48506 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLCP48506 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLCP48506 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLCP48506 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLCP48506 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLCP48506 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLCP48506 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLCP48506 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLCP48506 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLCP48506 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLCP48506 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLCP48506 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLCP48506 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLCP48506 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLCP48506 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCLCP48506 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCLCP48506 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCLCP48506 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCLCP48506 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCLCP48506 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCLCP48506 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms