Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UTRNP46939 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UTRNP46939 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UTRNP46939 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UTRNP46939 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UTRNP46939 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UTRNP46939 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UTRNP46939 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UTRNP46939 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UTRNP46939 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UTRNP46939 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
UTRNP46939 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
UTRNP46939 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UTRNP46939 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UTRNP46939 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UTRNP46939 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UTRNP46939 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UTRNP46939 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UTRNP46939 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
UTRNP46939 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UTRNP46939 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UTRNP46939 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UTRNP46939 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UTRNP46939 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
UTRNP46939 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UTRNP46939 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
UTRNP46939 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UTRNP46939 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
UTRNP46939 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UTRNP46939 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UTRNP46939 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UTRNP46939 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UTRNP46939 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UTRNP46939 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UTRNP46939 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UTRNP46939 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UTRNP46939 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UTRNP46939 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UTRNP46939 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UTRNP46939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UTRNP46939 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UTRNP46939 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UTRNP46939 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UTRNP46939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UTRNP46939 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UTRNP46939 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UTRNP46939 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UTRNP46939 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UTRNP46939 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms